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对此，卫生部公开表示"坚决反对这样的言论和做法"，并认为取消中医是"无知"；国家中医药管理局新闻发言人则称中医"是祖先留给我们的宝贵财富"，取消中医者"没有资格以科学的代言人自居"；而数百位全国中医院院长群情激愤，表示取消中医的主张"注定要失败"。
完全否定中医，不切合实际；过分夸大中医，缺乏充分理由。中医关乎民生，对中医存废的思考更需要对科学精神的追索。科学精神不仅是实验、共性、量化的严谨，而且是对经验、个性和未知的包容。
即使在基因图谱全部完成之后，人类对自身的认知依然是肤浅的。越来越多的所谓"疑难杂症"，恰恰说明人类还"幼稚"。而中医却对不少"疑难杂症"的个案发挥了疗效，虽然对病情给出的结论是"模糊"的、难以量化。
中医危机是文化危机
中医药学是在中华民族传统文化的土壤中萌生、成长的。中医药学在发展过程中，不断汲取当时的哲学、文学、数学、历史、地理、天文、军事学等多种学科知识的营养，同时又融进了中华民族优秀传统文化的血脉，而成为传统文化不可分割的一个组成部分。因此，中医药学在这种传统文化氛围中能够自然地得以普及。古代上自帝王将相、下至走卒贩隶，各个阶层或多或少都能知医识药，由儒从医者、由官业医者更是不胜枚举。"秀才学医，笼中抓鸡"，一方面形象地道出了具有传统文化知识背景的人学习中医相对容易之现象，另一方面也说明了中医与传统文化的密切关系。
近百年来，中医的发展出现了危机，一个时期甚至面临被取缔、被消灭的境地。从历史环境中看，中医的危机从根本上说就是中国传统文化的危机。伴随着新文化运动，中国的传统文化遭到猛烈的抨击，作为传统文化一部分的中医药学也不可避免地遭到前所未有的批判。在这样的语境中，中医成了"失语的中医"，丧失了自己的本体地位。
从现实的情况看，离开了中国传统人文文化教育和传播，中医药执业人员单纯学习中医诊断、方剂、药性，终究难成为一代中医名家（即使一时出名，也后劲不足）。中药也难以保持和发展道地药材与传统炮制方法。与中医药相关的产品、包括中医药文化产品也难以形成良好持久的市场氛围。离开文、史、哲等文化的滋养，中医理论也难以得到健康持续发展。从某种意义上来说，中医文化研究既担负着复兴传统文化的重要角色，也担负着推动医药市场经济发展的重任。
本来，作为传承中医药文化的重要阵地--中医药高等院校，应该是最有资格也是最应该弘扬传统文化的地方。但是，现代中医院校完全按照西方科学模式进行构建，用所谓的现代科技来研究中医药。中医院校一版又一版的教材也变得越来越"现代化"，语言表达也越来越"标准化"、"客观化"，而与传统文化密切相关的主干课程---医古文，也越来越被边缘化，在中医师职称考试中也已被取消，而换成能与西方科学接轨的现代语言工具--英语。其他与传统文化相关的课程，更只是作为中医院校可有可无的选修课。
中医"申遗" 风云再起
中国国家中医药管理局早在2003年就开始酝酿中医药申报世界文化遗产，组织有关专家进行细致调研，并与联合国教科文组织保持沟通。但直到最近迅速升温的所谓"韩国改中医为韩医申报'世遗'事件"，许多中国人才第一次注意到中国其实早已经有了"中医药申遗"的抱负。
中医药是遗产，需要申遗，西医药为什么不需要申遗？究竟是因为中医药有更久远的传承，需要成为"遗产"作纪念；还是因为它在现实里已经奄奄一息、命悬一线，迫切需要成为遗产受到保护？如果是后者，那么在申请保护之外，所有中医药工作者，所有中国人，似乎还有更急迫重要的工作去做。
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